【明智あんな】は、マコトミライタウンに暮らす14歳の中学２年生！
誕生日に現れた妖精【ポチタン】と
お部屋にあったペンダントに導かれて
2027年から1999年のまことみらい市に
タイムスリップ…！

そこで出会ったのは、
名探偵に憧れている14歳の女の子【小林みくる】！

そんな中、事件発生！？
大切なものを盗まれて困っている人がいるみたい…！
事件は【怪盗団ファントム】のしわざ…！？
困っている人を見逃せない…！
そんな思いから、あんなとみくるは【名探偵プリキュア】に
変身‼

名探偵プリキュアがみんなの笑顔を推理で守る！