ポチタンのおかげで助かったものの、ニジーにマコトジュエルをうばわれてしまったあんなとみくる。探偵事務所に戻り、あんながポチタンの様子を見ていると、みくるは「マコトジュエルを取り返してくる」と駆け出していきます。残されたあんなが新しいプリキットをみくるに渡せなかった理由を打ち明けると、ジェット先輩は「お前たちは運命の……いや、奇跡のふたりだ」と語り、あんなに後を追うように背中を押してくれました。
一方、みくるは再び訪れた学校で出会ったニジーを追い、虹ヶ浜に向かっていました。プリキットボイスメモで連絡をとり、同じ場所に向かうあんな。たどり着いた虹ヶ浜では、ニジーが怪盗団ファントムの一員のるるか、マシュタンとともに待ち構えていました。
ニジーが呼び出した2羽のハンニンダーを前に変身するアンサーとミスティック。海にさそい出されたものの、プリキットライトで作った足場を使って立ち向かいますが、ハンニンダーは合体して次々と足場を壊し、アンサーとミスティックは砂浜へと投げ出されます。
追い詰められた中、アンサーは学校で友だちと仲良く過ごすみくるの邪魔をしてはいけないと思ってしまったことを打ち明け、ミスティックはあんなに心細い思いをさせたことをあやまります。手をとり合いながらふたりが立ち上がると、ジェット先輩とともに駆けつけたポチタンが渡してくれたプリキットミラールーペから新たな技「プリキュア！　フライング・スペクトル！」が発動し、ハンニンダーを浄化することができました。
事務所に帰ってきたあんなたちは、真理子からロンドンにいる妹の恵子と連絡がとれたことを聞かされます。学園のツバメ像も戻り、幽霊さわぎも無事に解決され、あんなとみくるはお互いに笑顔を浮かべるのでした。