異世界からの逃亡者ゼノそしてリリスとの出会いと別れを経て、玉狛支部へ帰ってきた遊真、修、千佳は昇格を目指し休む暇もなくB級上位とのランク戦に向けて準備を始めるのだった。一方、大規模侵攻の後、捕虜となっていたヒュースが遂に本部基地へと連行される。城戸指令たちボーダー上層部の狙いとは一体…！？今、物語は新たな未来へと動き出す！