激戦の末、アフトクラトルは撤退、ここに第二次大規模侵攻は終結した。
しかし、その傷跡は決して浅くはなかった。
三門市の復旧に追われるボーダー、行方の分からなくなったレプリカを探す遊真、
そして、共に戦った仲間たちが見舞うも意識の戻らない修。
修は夢の中で思い出していた。なぜボーダーに入ったのか、なぜそこまでして千佳を守るのか。
修の過去がいま明らかになる…！！