エレンがプリキュアになったことにいらだつメフィストは、トリオ・ザ・マイナーをパワーアップさせて音符を集める能力を高め、不幸のメロディを完成させることに集中するように言う。一方、朝早く、響の家ではフェアリートーンたちが連携し、仕掛けを使って空中を飛んだりはねたりして響のおでこに乗り、響の目を覚まさせていた。まさかフェアリートーンたちがそんな訓練をしているとは知らない響とハミィ。フェアリートーンたちは他にも、響とハミィが気づかない中、全員集まって朝の会議を開いたりと日々チームワークを高めていた。

音符の匂いがよくわかるようになったトリオ・ザ・マイナーは、あちこちで音符をたくさん集めていた。同じく音符集めをする響、奏、エレン、ハミィだが、なかなか音符が集まらない。そんな中、子供につかまりそうになったハミィや、暑さでバテたみんなのためにいろいろな音を出して助けるフェアリートーンたち。そんなフェアリートーンを狙う怪しい影。響たちが音符集めの休けいにとジュースを飲んでいる裏でフェアリートーンたちが点呼をとるが、なんとレリーとラリーの姿がない。バリトンがレリーとラリー、そしてドリーを捕まえて、持っていた音符を全て奪ってしまったのだ。

響たちの前に現れたトリオ・ザ・マイナーは扇風機に音符を見つけてネガトーンにしてしまう。これまでよりもパワーアップしたネガトーンに驚く響たち。一方、ドリーたちは、他のフェアリートーンたちと力を合わせ、捕らえられた虫かごから逃げ出すが、代わりにシリーが捕まってしまう。プリキュアを変身させるためにシリーを残し、響たちのもとに駆けよるドリーたち。響たちはフェアリートーンの大変な状況に気づかないままプリキュアに変身。そこへ戻ってきたハミィにファルセットが気をそらしたスキに、連けいでシリーも助け出すフェアリートーンたち。

メロディ、リズム、ビートは扇風機ネガトーンの風攻撃に苦戦していたが、ソリーの集中力を高めるパワーで元気になると、三人それぞれ決め技を放ちネガトーンを撃退する。音符を一つ手に入れたハミィだったが、トリオ・ザ・マイナーは悔しがるどころか、自分達がたくさん集めた音符を見せて「僕らの勝ちだ」と高笑いで去っていくのだった。トリオたちの持っていた音符の多さに落ち込む響たちを懸命に元気づけるフェアリートーン。勇気付けられた響は不幸のメロディなんて絶対完成させない、と意気込む。しかしその耳に「それだけではダメ」と誰かがささやく声が聞こえるのだった。