なくなったプリンセスパフュームを探すアロマたち。でも、はるかは初めての当番で、ノーブル学園の学生寮にいました。風紀委員長の如月れいこの厳しい指導のもと、当番をガンバるはるか。何とか無事に当番も終わると思っていたら、パフがれいこに見つかってしまいます。

犬だと思われたパフは規則で寮にはいられません。そこではるかはみんなに新しい規則を作って、パフを寮で飼うことを提案します。期限は一週間、はるかのアピール作戦でほとんどの生徒がパフを飼うことに賛成しました。でも、れいこは犬が大の苦手だったのです。

新たなディスダーク三銃士のシャットが、ゼツボーグを連れて現れました。駆けつけたプリンセスプリキュアは、逃げ遅れたれいこに、パフについて逃げるよう言います。でも、今度はクローズのゼツボーグに襲われてしまいました。れいこを守るため、一人でゼツボーグに挑むパフ。

プリンセスプリキュアの活躍で2体のゼツボーグは浄化され、学園に平和が戻ります。そして、約束の一週間が経ちました。最後まで反対していたれいこですが、パフに助けられたことで考えを改め、賛成してくれます。こうしてパフは寮に居ることが認められました。大喜びのはるかとパフ。でも、なくしたプリンセスパフュームは見つからないままでした…