総集編 第１部ストーリー
総集編 第２部ストーリー
今からずっーと未来の話。人間は滅び、マトリクサーと呼ばれる新合成生命体の世界になっていた。戦士を目指す主人公の少年「マシュラ」は協調性なし、根気なし、やんちゃな性格で落ちこぼれ！
そんなある日、マシュラはいたずらが元で滝壺に鎖で吊るされてしまう。脱出できないまま幾日かが過ぎ、瀕死のところを美しい少女「ヤクモ」に助けられる。九死に一生を得たマシュラは、助けてくれた少女ヤクモが、なんと滅びたはずの「人間」であることを知って驚く！この世界では人間は世界を滅ぼすと言われ、悪魔だと伝えられていたのだ！
しかしマシュラには、ヤクモが悪魔どころか、マトリクサーよりも優しい天使のように思えた。「恐くないのですか、私が？」「恐いもんなんてないぜ、オレには。お前の事、人間だからっていじめるヤツがいたら、オレがぶっ飛ばしてやる！」
ヤクモは伝説の地「センター」を目指していた。そこに行けば滅びた人間の秘密が明らかになると言うのだ。マシュラはヤクモを助けて、ともに旅をすることになった。マシュラは怒りの感情が頂点に達した時、ハイパーマトリクサー「ハイパーマシュラ」に変身する能力で、もの凄いパワーを爆発させ、次々に悪いマトリクサーたちを倒してゆくのだ！
やがて「クータル」と「サーゴ」の二人の仲間も加わった。クータルはコックで食いしん坊。サーゴはカッコつけのアウトロー。共にあくの強い個性的なマトリクサーである。しかし協調性がないこのでこぼこ三人組も、戦いでは見事なフォーメーションでバトルを展開する！やがて予期できない意外な展開を生むことに・・・！？
数えきれない喧嘩や失敗も多々あるが、マシュラたちはヤクモを守って、未来の地球を舞台に壮大な旅をする。
2000年2月～9月 毎週土曜日 18時30分～19時 テレビ朝日系で放送
マトリクサーが支配する地球で目覚めた人間の少女ヤクモの苦難の旅がはじまる！
六大将軍の力を取り込み、悪魔と化したサタンマシュランボーとの死闘までを描く第１部！
人類とマトリクサーの最終戦争が勃発。 さらに宇宙から巨大隕石が衝突する。 最終的には人類が滅びるが、神童博士は娘の ヤクモをハクバー内に300年後に目覚める様、 コールドスリープ(冷凍睡眠)させ、望みを託す。
マトリクサーのみの世界で荒れ果てている。 目覚めたヤクモは人類唯一の生き残りとなる。 マトリクサーにとって人間は300年前に滅亡 したはずの伝説の悪魔として言い伝えられて いるため、ヤクモは普通のマトリクサーから も迫害される。
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歴史が塗り替えられ、人類とマトリクサーが共存する地球を舞台にカードリアンとの戦いの火蓋は切られた！ 最強のラナンキュラスを倒せるか！？感動のエンディングを迎える第２部！
ラナンキュラスとカードリアンは宇宙の戦士たちに よって隕石に封印され、地球に衝突した。その衝撃で強大なエネルギーが「幼いヤクモ」と「マシュランボー」に融合する。
カードリアン達はラナンキュラスを復活させる為 地球に侵略し、復活を妨げる「ヤクモ」を抹殺しようとしている。 ヤクモは祈りの力によってラナンキュラスの復活を阻止しているが、かなり消耗してしまう。ヤクモの生命力が絶える時、ラナンキュラスは完全復活する。
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（C)東堂いづみ・東映アニメーション
