崩壊したパライストラから脱出した光牙たちは聖闘士の総本山である聖域に向かう。だが、聖域にあった十二宮は破壊され、その代わりに不気味なバベルの塔がそびえ立っていた。光牙は光の小宇宙を持つ少女を救出するため、バベルの塔への潜入をこころみる！