大輔と賢に続き、第２のジョグレス進化を成功させた京とヒカリ。一方アルケニモンの元を去ったブラックウォーグレイモンは、満たされない思いを胸に、デジタルワールドをあてもなくさまよい続けていた。 　自分はなぜ作られたのか。何をするべきなのか。作られた存在である自分に疑問を感じながら、ひたすら戦いに明け暮れるブラックウォーグレイモン。だがどんなに激しい戦いも胸の空洞を埋めることはできず、逆にむなしさだけが積み重なっていく。そんなときブラックウォーグレイモンの前に現れたのは、太一のパートナー・アグモンだった。 　ブラックウォーグレイモンの迷いを知り、なんとか心を開こうとするアグモン。アグモンとの運命の出会いは、ブラックウォーグレイモンに何をもたらすのだろうか？　そしてデジタルワールド存亡のカギをにぎるホーリーストーンとは、はたして……！？ 「命のない、生き物ではない俺に心があって何が得られるのだ？」