すべての過去を受け入れることで本当の自分を取りもどし、ワームモンとの再会をはたした一乗寺賢。だがやっと訪れた小さな平和を奪い去るべく、妖しげな女が賢とワームモンの前に立ちはだかる！ 　一方デジタルワールドの復旧を手伝う伊織は、各地に残されたカイザーの爪跡を目の当たりにして賢への怒りをつのらせていた。だがそんな伊織の心のスキを突くように、突然現れたサンダーボールモンが襲いかかる！　イービルリングを持たない敵との初めての戦いに戸惑う伊織。そんな伊織の危機を救ったのは、謎の緑色の戦士だった……。 　現れた新たな敵。複雑にからみあうそれぞれの想い。多くの謎を秘めたまま、今、ついに真の戦いが幕を開ける……！！ 「どうして助けてくれたんだ。あんなやつが僕のこと」